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ここがわかりやすかったので、覚書。というかコピペ。官舎
dv <- c(8,6,7,7,6,4,5,5,6,3,5,3,3,6,2,3,4,2,2,3,6,7,5,4,6)
grp <- gl(5,5)
aovres <- aov(dv~grp)
summary(aovres)
model.tables(aovres)
# デフォルトの対比
options()$contrasts
contrasts(grp)
# ヘルマート対比で検定
coef.hel <- contr.helmert(5)
coef.hel
contrasts(grp) <- coef.hel
aovres.h <- aov(dv~grp)
summary(aovres.h, split=list(grp=c(1,2,3,4)))
# grp: C1 1 12.100 12.100 9.0299 0.0069971 ** grp1 vs. grp2
# grp: C2 1 12.033 12.033 8.9801 0.0071289 ** grp1&2 vs. grp3
# grp: C3 1 19.267 19.267 14.3781 0.0011441 ** grp1&2&3 vs. grp4
# grp: C4 1 4.840 4.840 3.6119 0.0718780 . grp1&2&3&4 vs. grp5
# 多項式対比で検定
coef.ply <- contr.poly(5)
coef.ply
contrasts(grp) <- coef.ply
aovres.p <- aov(dv~grp)
summary(aovres.p, split=list(grp=c(1,2,3,4)))
# 自分で対比を設定する
coef.s <- cbind(c(1,-1,1,0,-1), c(-1,-1,-1,4,-1))
coef.s
sum(coef.s)
contrasts(grp) <- coef.s
aovres.s <- aov(dv~grp)
summary(aovres.s, intercept=T, split=list(grp=c(1,2)))
# grp: C1 1 0.20 0.20 0.1493 0.7033289 # grp1&3 vs. grp2&5
# grp: C2 1 23.04 23.04 17.1940 0.0004994 *** # grp4 vs. grp1&2&3&5
dv <- c(8,6,7,7,6,4,5,5,6,3,5,3,3,6,2,3,4,2,2,3,6,7,5,4,6)
grp <- gl(5,5)
aovres <- aov(dv~grp)
summary(aovres)
model.tables(aovres)
# デフォルトの対比
options()$contrasts
contrasts(grp)
# ヘルマート対比で検定
coef.hel <- contr.helmert(5)
coef.hel
contrasts(grp) <- coef.hel
aovres.h <- aov(dv~grp)
summary(aovres.h, split=list(grp=c(1,2,3,4)))
# grp: C1 1 12.100 12.100 9.0299 0.0069971 ** grp1 vs. grp2
# grp: C2 1 12.033 12.033 8.9801 0.0071289 ** grp1&2 vs. grp3
# grp: C3 1 19.267 19.267 14.3781 0.0011441 ** grp1&2&3 vs. grp4
# grp: C4 1 4.840 4.840 3.6119 0.0718780 . grp1&2&3&4 vs. grp5
# 多項式対比で検定
coef.ply <- contr.poly(5)
coef.ply
contrasts(grp) <- coef.ply
aovres.p <- aov(dv~grp)
summary(aovres.p, split=list(grp=c(1,2,3,4)))
# 自分で対比を設定する
coef.s <- cbind(c(1,-1,1,0,-1), c(-1,-1,-1,4,-1))
coef.s
sum(coef.s)
contrasts(grp) <- coef.s
aovres.s <- aov(dv~grp)
summary(aovres.s, intercept=T, split=list(grp=c(1,2)))
# grp: C1 1 0.20 0.20 0.1493 0.7033289 # grp1&3 vs. grp2&5
# grp: C2 1 23.04 23.04 17.1940 0.0004994 *** # grp4 vs. grp1&2&3&5
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